男性不育症的原因很多，归纳起来主要有四类。
    1．性功能正常性男性不育症
    (1)精液异常因素：主要包括导致少精子、无精子的原因有隐睾、精索静脉曲张、染色体异常、不良生活习惯等因素，引起睾丸产生精子功能障碍，先天畸形或感染因素如淋病、结核或非特异性感染造成的输精管道的阻塞等；某些全身因素慢性消耗性疾病如重症结核、肝炎等造成长期营养不良，酒精慢性中毒、药物中毒均可能抑制精子产生。垂体肿瘤引起功能减退可以阻碍精子的产生。内分泌功能障碍如肾上腺皮质功能亢进、甲状腺功能减退均影响睾丸内精子的产生；
    (2)导致精子活力低下、减退、畸形率增加、顶体反应能力减弱等因素：如慢性前列腺炎、生殖系统结核、淋球菌感染、沙眼衣原体、解脲脲原体、人型支原体等非特异性感染等；
    (3)精液不液化：主要是由于精囊分泌果糖的功能发生障碍。
    以上因素，不会影响夫妻间正常的性生活，外观看上去没有什么异常，只是在医生的系统检查后才可以发现。
    2．性功能障碍性不育症
    主要为精子不能正常进入女性生殖道，无法完成正常的精卵结合。常见的因素有心理性、血管性、内分泌性及其部分药物性等因素引起的性功能障碍，这些因素往往导致不能完成正常的性交，或阳痿，或早泄，或不射精，或逆行射精。此外，如果外生殖器损伤、缺损或畸形，也会影响性生活，造成男性不育症。
    3．遗传性疾病引起的男性不育症
    有性染色体异常、常染色体畸变、减数分裂染色体异常等，一般表现为少精子或无精子，即使有精子发育也往往停滞于精母细胞水平，而不能继续分化为精子。这样的疾病，一般性功能属于正常，没有其他方面的明显异常。
    4．免疫性不育
    也是颇为常见的不育因素，如男性抗精子抗体常常与精子膜表面结合而干扰精子在宫颈黏液中的运动方向，影响精子顶体反应，阻碍精子穿透卵子透明带的能力，导致不能形成受精卵。不仅如此，抗精子抗体阳性可以直接导致精子数量减少或质量低下，使精子丧失受精能力，出现有精子、有生育能力却不能使妻子受孕的现象。