妊娠期无症状菌尿虽然没有明显症状，但也属泌尿道感染，故治疗以抗生素为主。

在应用抗生素之前，应先查找诱因，并给予治疗。如有尿路结石者，应去除结石。

由于一些抗生素对胎儿有影响，所以在选择时应慎重。

(1)磺胺药：为首选药。首次剂量应加倍。因它能导致新生儿黄疸或溶血，在妊娠晚期应禁用。

(2)青霉素：对病程短，肾实质损害轻者可应用。

使用抗生素时应适量，疗程要足，为防止复发，可延长用药时间。